在十年“文革”中，鲍蕙荞沦落为艺术领域内的卜亏受批判对象，随后受庄则栋政治上一泄千里之累，一度四面楚歌。在“文革”中，鲍蕙荞的工程师爸爸被打孝樱成“反动权威”，被迫隔离审查。她的丈夫庄则栋，因为反对批斗国家体委主任荣高棠，被指控为“修正主义的黑尖子”，也成了批判斗争的重点对象。加之哥哥和姐姐都有“政治问题”，鲍蕙荞陷入四面楚歌的境地。
鲍蕙荞和庄则栋的第一个孩子出生时，鲍蕙荞来不及享受做母亲的喜悦，也被下放到农场，接受所谓的“劳动改造”。在那儿待了将近两年，种水稻。很难得回家，回家的时候，儿子也认不出她了。
1968年秋天，庄则栋得以释放。一年后，在周恩来直接关照下，庄则栋恢复了日常训练和参加比赛的资格。1970年，鲍蕙荞也因为江青直接过问，结束“改造”，鲍蕙荞回到了北京，再次登上舞台弹《黄河》 ，弹样板戏。鲍蕙荞从农场调到中央乐团后，开始很感激江青，后来渐渐看到许多人对她不满，便一再提醒丈夫，保持跟江青的距离，尽量向周恩来靠拢。从这时起，鲍蕙荞和丈夫之间有了分歧和矛盾。
1976年秋天，“文革”十年浩劫划上了句号，随着江青集团彻底倒台，庄则栋也被免去了国家体委主任的职务，隔离审查，又把鲍蕙荞牵连进去。
在最初的日子里，鲍蕙荞也被禁止演出，每天只能给学生们伴奏钢琴。鲍蕙荞和庄作栋曾经是令人羡慕的一对儿，但是两人在文革中的遭遇使他们在感情上和生活上越走越远，最终分手。上世纪80年代中巧弊丛期，庄则栋被没有结论地释放回家，但他们的情感世界已经出现无可挽回的巨大裂痕。1985年，在北京东城区政府办理了离婚手续。